Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Bend3Q6PAL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Bend3Q6PAL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,07■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Bend3Q6PAL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Bend3Q6PAL0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Bend3Q6PAL0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Bend3Q6PAL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Bend3Q6PAL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Bend3Q6PAL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Bend3Q6PAL0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Bend3Q6PAL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Bend3Q6PAL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Bend3Q6PAL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Bend3Q6PAL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29,7■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,3 ms