Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Caskin1Q6P9K8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Caskin1Q6P9K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Caskin1Q6P9K8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Caskin1Q6P9K8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Caskin1Q6P9K8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Caskin1Q6P9K8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Caskin1Q6P9K8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Caskin1Q6P9K8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Caskin1Q6P9K8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Caskin1Q6P9K8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Caskin1Q6P9K8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Caskin1Q6P9K8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Caskin1Q6P9K8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Caskin1Q6P9K8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Caskin1Q6P9K8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Caskin1Q6P9K8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Caskin1Q6P9K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Caskin1Q6P9K8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Caskin1Q6P9K8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Caskin1Q6P9K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Caskin1Q6P9K8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms