Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Senp6Q6P7W0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Senp6Q6P7W0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp6Q6P7W0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp6Q6P7W0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Senp6Q6P7W0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Senp6Q6P7W0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Senp6Q6P7W0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Senp6Q6P7W0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms