Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh2Q6P6J4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh2Q6P6J4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alkbh2Q6P6J4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alkbh2Q6P6J4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Alkbh2Q6P6J4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Alkbh2Q6P6J4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms