Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga2Q6P5E6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga2Q6P5E6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga2Q6P5E6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gga2Q6P5E6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gga2Q6P5E6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms