Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Colgalt2Q6NVG7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Colgalt2Q6NVG7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Colgalt2Q6NVG7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Colgalt2Q6NVG7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Colgalt2Q6NVG7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms