Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpsf6Q6NVF9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf6Q6NVF9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf6Q6NVF9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf6Q6NVF9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf6Q6NVF9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms