Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Frem2Q6NVD0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frem2Q6NVD0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frem2Q6NVD0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frem2Q6NVD0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frem2Q6NVD0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Frem2Q6NVD0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms