Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RragbQ6NTA4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RragbQ6NTA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RragbQ6NTA4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RragbQ6NTA4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RragbQ6NTA4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RragbQ6NTA4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RragbQ6NTA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RragbQ6NTA4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RragbQ6NTA4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms