Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ggnbp1Q6K1E7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ggnbp1Q6K1E7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ggnbp1Q6K1E7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ggnbp1Q6K1E7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms