Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cep290Q6A078 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cep290Q6A078 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cep290Q6A078 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep290Q6A078 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cep290Q6A078 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep290Q6A078 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms