Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pds5aQ6A026 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pds5aQ6A026 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pds5aQ6A026 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pds5aQ6A026 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pds5aQ6A026 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pds5aQ6A026 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pds5aQ6A026 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pds5aQ6A026 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pds5aQ6A026 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pds5aQ6A026 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pds5aQ6A026 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pds5aQ6A026 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms