Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH4

Galk2, N-acetylgalactosamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galk2Q68FH4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Galk2Q68FH4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Galk2Q68FH4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Galk2Q68FH4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Galk2Q68FH4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Galk2Q68FH4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Galk2Q68FH4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Galk2Q68FH4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Galk2Q68FH4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Galk2Q68FH4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Galk2Q68FH4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Galk2Q68FH4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Galk2Q68FH4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms