Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pkp4Q68FH0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp4Q68FH0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp4Q68FH0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp4Q68FH0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp4Q68FH0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp4Q68FH0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms