Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprcapQ64697 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprcapQ64697 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprcapQ64697 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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PtprcapQ64697 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprcapQ64697 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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PtprcapQ64697 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprcapQ64697 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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PtprcapQ64697 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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PtprcapQ64697 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprcapQ64697 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprcapQ64697 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprcapQ64697 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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PtprcapQ64697 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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PtprcapQ64697 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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PtprcapQ64697 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprcapQ64697 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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PtprcapQ64697 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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PtprcapQ64697 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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PtprcapQ64697 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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PtprcapQ64697 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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PtprcapQ64697 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprcapQ64697 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprcapQ64697 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprcapQ64697 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprcapQ64697 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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PtprcapQ64697 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprcapQ64697 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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PtprcapQ64697 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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PtprcapQ64697 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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PtprcapQ64697 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprcapQ64697 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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PtprcapQ64697 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprcapQ64697 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprcapQ64697 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprcapQ64697 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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PtprcapQ64697 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
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PtprcapQ64697 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprcapQ64697 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprcapQ64697 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprcapQ64697 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprcapQ64697 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprcapQ64697 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprcapQ64697 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprcapQ64697 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms