Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms