Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt12Q64291 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt12Q64291 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt12Q64291 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt12Q64291 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt12Q64291 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt12Q64291 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt12Q64291 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms