Protein–RNA interactions for Protein: Q64267

Xpa, DNA repair protein complementing XP-A cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpaQ64267 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XpaQ64267 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpaQ64267 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpaQ64267 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpaQ64267 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XpaQ64267 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpaQ64267 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpaQ64267 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpaQ64267 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpaQ64267 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpaQ64267 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpaQ64267 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XpaQ64267 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpaQ64267 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpaQ64267 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpaQ64267 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XpaQ64267 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XpaQ64267 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms