Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pan3Q640Q5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pan3Q640Q5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pan3Q640Q5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pan3Q640Q5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pan3Q640Q5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pan3Q640Q5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms