Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga3Q62470 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga3Q62470 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga3Q62470 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itga3Q62470 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga3Q62470 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga3Q62470 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga3Q62470 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms