Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx1Q62443 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx1Q62443 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx1Q62443 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nptx1Q62443 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nptx1Q62443 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nptx1Q62443 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nptx1Q62443 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nptx1Q62443 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nptx1Q62443 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms