Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccl12Q62401 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccl12Q62401 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccl12Q62401 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccl12Q62401 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccl12Q62401 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms