Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrmsQ62270 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SrmsQ62270 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SrmsQ62270 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrmsQ62270 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SrmsQ62270 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrmsQ62270 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrmsQ62270 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrmsQ62270 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms