Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox19Q62249 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sox19Q62249 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox19Q62249 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox19Q62249 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox19Q62249 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms