Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema5aQ62217 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema5aQ62217 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema5aQ62217 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema5aQ62217 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema5aQ62217 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema5aQ62217 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms