Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema4bQ62179 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema4bQ62179 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4bQ62179 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema4bQ62179 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4bQ62179 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4bQ62179 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms