Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema4aQ62178 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema4aQ62178 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sema4aQ62178 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema4aQ62178 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4aQ62178 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4aQ62178 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4aQ62178 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4aQ62178 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4aQ62178 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4aQ62178 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4aQ62178 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema4aQ62178 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms