Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrn1Q61809 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn1Q61809 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn1Q61809 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn1Q61809 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn1Q61809 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms