Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HlxQ61670 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HlxQ61670 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlxQ61670 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlxQ61670 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlxQ61670 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HlxQ61670 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HlxQ61670 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HlxQ61670 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HlxQ61670 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HlxQ61670 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HlxQ61670 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HlxQ61670 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HlxQ61670 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HlxQ61670 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HlxQ61670 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HlxQ61670 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HlxQ61670 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HlxQ61670 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HlxQ61670 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HlxQ61670 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HlxQ61670 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HlxQ61670 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HlxQ61670 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HlxQ61670 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HlxQ61670 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HlxQ61670 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HlxQ61670 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HlxQ61670 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HlxQ61670 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HlxQ61670 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HlxQ61670 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HlxQ61670 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HlxQ61670 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HlxQ61670 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HlxQ61670 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HlxQ61670 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HlxQ61670 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HlxQ61670 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HlxQ61670 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms