Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ifi47Q61635 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ifi47Q61635 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ifi47Q61635 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifi47Q61635 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifi47Q61635 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifi47Q61635 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms