Protein–RNA interactions for Protein: Q61627

Grid1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grid1Q61627 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grid1Q61627 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grid1Q61627 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grid1Q61627 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grid1Q61627 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grid1Q61627 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grid1Q61627 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grid1Q61627 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grid1Q61627 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grid1Q61627 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms