Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd55Q61475 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd55Q61475 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd55Q61475 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd55Q61475 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd55Q61475 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd55Q61475 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd55Q61475 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms