Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msi1Q61474 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msi1Q61474 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Msi1Q61474 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msi1Q61474 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msi1Q61474 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msi1Q61474 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msi1Q61474 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms