Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde3bQ61409 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde3bQ61409 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pde3bQ61409 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde3bQ61409 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pde3bQ61409 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pde3bQ61409 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms