Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Igbp1Q61249 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Igbp1Q61249 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Igbp1Q61249 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Igbp1Q61249 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Igbp1Q61249 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Igbp1Q61249 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Igbp1Q61249 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Igbp1Q61249 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms