Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nell2Q61220 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nell2Q61220 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nell2Q61220 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nell2Q61220 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nell2Q61220 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nell2Q61220 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nell2Q61220 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nell2Q61220 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nell2Q61220 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nell2Q61220 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms