Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pik3c2aQ61194 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pik3c2aQ61194 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Pik3c2aQ61194 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pik3c2aQ61194 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pik3c2aQ61194 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pik3c2aQ61194 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Pik3c2aQ61194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pik3c2aQ61194 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pik3c2aQ61194 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms