Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Astn1Q61137 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Astn1Q61137 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Astn1Q61137 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Astn1Q61137 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Astn1Q61137 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Astn1Q61137 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Astn1Q61137 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Astn1Q61137 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Astn1Q61137 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Astn1Q61137 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Astn1Q61137 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Astn1Q61137 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Astn1Q61137 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms