Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lamb3Q61087 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lamb3Q61087 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lamb3Q61087 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamb3Q61087 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamb3Q61087 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms