Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp4Q60972 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp4Q60972 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp4Q60972 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp4Q60972 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbbp4Q60972 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbbp4Q60972 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms