Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kpna1Q60960 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kpna1Q60960 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kpna1Q60960 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kpna1Q60960 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kpna1Q60960 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kpna1Q60960 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms