Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Meis1Q60954 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Meis1Q60954 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Meis1Q60954 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Meis1Q60954 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Meis1Q60954 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis1Q60954 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Meis1Q60954 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Meis1Q60954 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms