Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SkiQ60698 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SkiQ60698 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SkiQ60698 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SkiQ60698 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SkiQ60698 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SkiQ60698 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SkiQ60698 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SkiQ60698 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SkiQ60698 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SkiQ60698 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SkiQ60698 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SkiQ60698 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SkiQ60698 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SkiQ60698 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SkiQ60698 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SkiQ60698 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SkiQ60698 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SkiQ60698 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SkiQ60698 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SkiQ60698 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms