Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb6Q60692 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb6Q60692 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb6Q60692 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb6Q60692 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms