Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprnQ60673 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprnQ60673 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprnQ60673 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprnQ60673 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprnQ60673 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms