Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClpbQ60649 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClpbQ60649 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpbQ60649 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClpbQ60649 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClpbQ60649 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClpbQ60649 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms