Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr2f1Q60632 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr2f1Q60632 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nr2f1Q60632 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nr2f1Q60632 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nr2f1Q60632 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms