Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp78Q5U406 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfp78Q5U406 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfp78Q5U406 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp78Q5U406 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp78Q5U406 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp78Q5U406 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms