Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr1Q5SWD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr1Q5SWD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tsr1Q5SWD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tsr1Q5SWD9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsr1Q5SWD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tsr1Q5SWD9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms