Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PfasQ5SUR0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PfasQ5SUR0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PfasQ5SUR0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PfasQ5SUR0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PfasQ5SUR0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PfasQ5SUR0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms