Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctc1Q5SUQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctc1Q5SUQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctc1Q5SUQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctc1Q5SUQ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctc1Q5SUQ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctc1Q5SUQ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctc1Q5SUQ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms